農作物種質資源庫實際上我們可以將其看成是農作物種質資源“基因”庫，不同的農作物種質資源手機整理過后，都可以進入農作物種質資源庫中長期儲藏，而后續要進行農作物品種育種的時候，只需要在農作物種質資源庫中調用需要的農作物種質資源“基因”，就可以利用好這些優秀的農作物種質資源“基因”，培養出品質更佳、產量更好的農作物新品種，真正致力于農業生產。

      在我國不少地區，各地都有適合在當地生長的農作物資源，而利用農作物種質資源庫全力打造地區性農作物種質資源“基因”庫，可以幫助當地期農業部門充分做好地域資源的優勢和利用，擴大農作物種質資源的戰略儲備，強化種質資源的精準鑒定和深度挖掘，為現代種業發展和無公害蔬菜市場提供更有力的保障。
      改良農作物品種，與農作物種質資源保護是密不可分的，這是因為農作物種質資源，蘊藏在農作物各類品種、品系、類型、野生種和近緣植物中，是改良農作物的基因來源。而且隨著社會的發展，人類未來面臨的食物、能源和環境危機的解決都將有賴于種質資源的占有。因此在現階段，利用農作物種質資源庫全力打造農作物種質資源“基因”庫，搶救和保護這些優秀的農作物種質資源變得越來越重要，已經成為加強種質創新利用，提升我國種業國際競爭力的重要技術力量，農作物種質資源庫在科研單位、育種單位、企業、地方和大眾用戶中的應用也越來越廣泛。